Polymerer Strukturdetails

Di- und Polypeptide II

Am Beispiel des Hämoglobins

Primärstruktur

Aminosäuresequenz der beiden α-Ketten (im Einbuchstaben-Code) des Hämoglobins:
  1 VLSPADKTNV KAAWGKVGAH AGEYGAEALE RMFLSFPTTK TYFPHFDLSH 
 51 GSAQVKGHGK KVADALTNAV AHVDDMPNAL SALSDLHAHK LRVDPVNFKL 
101 LSHCLLVTLA AHLPAEFTPA VHASLDKFLA SVSTVLTSKY R 
        
Aminosäuresequenz der beiden β-Ketten (im Einbuchstaben-Code) des Hämoglobins:
  1 VHLTPEEKSA VTALWGKVNV DEVGGEALGR LLVVYPWTQR FFESFGDLST 
 51 PDAVMGNPKV KAHGKKVLGA FSDGLAHLDN LKGTFATLSE LHCDKLHVDP 
101 ENFRLLGNVL VCVLAHHFGK EFTPPVQAAY QKVVAGVANA LAHKYH 
        

Sekundärstruktur

Aminosäuresequenz der beiden α-Ketten (im Einbuchstaben-Code) des Hämoglobins
mit Kennzeichnung der verschiedenen Sekundärstruktur-Bereiche:
FaltungstypAbkürzung(en)
α-Helix(H, G)
β-Faltblatt(E-sheet)
Knick bzw. Biegung(T, von "Turn", S)

 
1 VLSPADKTNV KAAWGKVGAH AGEYGAEALE RMFLSFPTTK TYFPHFDLSH
   HHHHHHH HHHHHHHGGG HHHHHHHHHH HHHHHSGGGG GG TTS  ST 
51 GSAQVKGHGK KVADALTNAV AHVDDMPNAL SALSDLHAHK LRVDPVNFKL
T HHHHHHHH HHHHHHHHHH HTTT HHHHS HHHHHHHHHT T   HHHHHH 
101 LSHCLLVTLA AHLPAEFTPA VHASLDKFLA SVSTVLTSKY R
HHHHHHHHHH HH TTT  HH HHHHHHHHHH HHHHHHHTT   
Aminosäuresequenz der beiden β-Ketten (im Einbuchstaben-Code) des Hämoglobins
mit Kennzeichnung der verschiedenen Sekundärstruktur-Bereiche:
1 VHLTPEEKSA VTALWGKVNV DEVGGEALGR LLVVYPWTQR FFESFGDLST
    HHHHHH HHHHHTT  H HHHHHHHHHH HHHHSGGGGG GGGGG   SS 
51 PDAVMGNPKV KAHGKKVLGA FSDGLAHLDN LKGTFATLSE LHCDKLHVDP
HHHHHH HHH HHHHHHHHHH HHHHGGGTT  HHHHHHHHHH HHHHTT   T 
101 ENFRLLGNVL VCVLAHHFGK EFTPPVQAAY QKVVAGVANA LAHKYH
HHHHHHHHHH HHHHHHHHGG GS HHHHHHH HHHHHHHHHH HSTT  

Tertiärstruktur

A1 Einer der beiden α-Ketten des Hämoglobins:

A2 Des Enzyms Lysozym:

A3 Des als Protonenpumpe wirkenden Bakterienrhodopsins:

Quartärstruktur

A4 Des Hämoglobins mit den beiden α-Ketten und den beiden β-Ketten:

A5 Eines Ausschnitts auf dem Gerüstprotein Kollagen:


Externe Links

Primärstruktur Sekundärstruktur Tertiärstruktur Quartärstruktur RSCB Proteindatenbank NCBI Protein- und Nucleinsäure-Datenbank Jmol Scripting Tutorial